Létezik olyan szoftver, ami az irodalmi hivatkozásokat egy adott folyóirat által kért formába rendezi?

Persze. Gizi néni, a titkárnő, 3.1 verziója...

Nem írtad hogy milyen formátumban írod a cikked (Word, LaTeX), vagy hogyan kezeled a hivatkozásokat jelenleg. A Mendeley elég univerzális mindenesetre, én azt használom.

Hát, akkor ez mindenképp szívás lesz. Mostmár így második körben viszont ne pötyögd be újra, hanem használj hivatkozáskezelőt. Eddig úgy csináltad, hogy kézzel, szövegként beírtad, hogy [1], [2] vagy (Józsi, 2009) és a végére az irodalomjegyzékben kiírtad a teljes forrást szintén kézzel? Mert ez esetben még ha ugyanígy be is pötyögnéd, a folyóirat megkérne hogy csináld meg rendesen, hivatkozás objektumokkal mivel nem tudják automatikusan konvertálni pl. az online felületükre.

Én a Zotero-t használom, ott csak beírod egy adatbázisba a cikkek bibliográfiai adatait, és amikor hivatkozol, akkor kiválaszthatod a formátumot, én pl. az APA formátumát használom.