Ha a főiskolán csak az első szemesztert csináltam meg, a másodikon passzív voltam, el tudom kezdeni a második szemesztert a következő év elején? Mármint ami már a harmadik szemeszter lenne?

Nem tudod így csinálni. A tárgyakat - a mintatanterv sajátosságai miatt - általában csak őszi vagy csak tavaszi félévben hirdetik meg, mert így célszerű. Ha tehát "kihagyod" a második félévet, akkor a harmadik félévben csak azokat a tárgyakat veheted fel, amiket az elsőben felvettél, esetleg azokat, amiket harmadik félévben vehetsz fel, mert megvannak az előfeltételek. Vagy még ott vannak azok a második féléves tantárgyak, amelyeket kiírnak keresztfélévben, de ez nagyon ritka, nem szoktak vele erőlködni, mert keresztféléves tárgyak nélkül is van elég oktatnivalója a tanszékeknek.

Vagy újra elvégzed (ha épp kedved van hozzá, de felesleges és ha megvannak a vizsgáid, nem is lehet), vagy két passzív félév után folytatod a következő januárban.