Ha egy programot rárakok pendrive-ra és utána leformázom a partíciót és új op-t rakok a gépemre akkor ha pendrive-ról visszarakom a gépre a programot akkor elvesznek a beállítások és újra kell telepítenem a programot?

Attól függ, hogy az a program hol tárolja a beállításait, és hogy azokat te átmásolod-e.

Ha csak a Program Files-ban lévő mappáját másolod, az szinte biztos, hogy nem tartalmaz beállításokra vonatkozó állományokat. Ilyenkor érdemes a saját könyvtárat az applikációs mappát is másolni (a programokhoz általában van leírás, hogy hol tárolják ezeket).

Van, ami a registry-be is beszemetel.

Sőt, igazából ha csak a beállítások kellenek, akkor kár a Program Files-ban lévő dolgokat másolni, elég a beállításokat. Ha fenn a rendszer, felteszed a programot és behúzod a beállításokat.

C:\Users\*felhasználóneved*\AppData\Roaming

Ebből a Roaming mappából mentsd ki azoknak a programoknak a mappáit, melynek beállításait vissza akarod állítani op újratelepítés után. Persze majd az új rendszerben és a progik telepítése után ugyanide másold vissza. Skype-hoz, aimp-hoz, utorrent-hez szoktam ezt alkalmazni és tökéletes. Pl. firefox-hoz van MozBackup nevű biztonsági mentő, vagy használd a firefox sync-et. Chrome beállítások esetén fav backup nevű progi.